Identificazione di cloni bac di Citrus sinensis contenenti geni rilevanti per la qualità dei frutti

Utilizzando la EST assembly C38 (http://harvest.ucr.edu/) e il software "OligoSpawn" (http://138.23.178.42), sono state selezionate 81 sonde overgo associate con unigene che codificano per gli enzimi strutturali delle vie biosintetiche aventi un ruolo rilevante nel determinare la qualità dei frutti. Con le sonde selezionate è stato effettuato lo screening di una BAC library (19x) di Citrus sinensis cv Vaniglia per individuare i cloni contenenti i corrispondenti geni. Degli 81 geni selezionati, 75 sono stati individuati, corrispondenti ad un totale di 1018 cloni BAC. La mappatura dei BACs individuati contro il genoma di Citrus clementina (http://phytozome.net) ha dimostrato che i cloni corrispondenti a ciascuna sonda sono posizionati all'interno dello stesso scaffold contenente il gene target, confermando che la metologia seguita è stata vincente nell'isolare i geni oggetto del presente studio.