Transcriptome Viewer

Transcriptome Viewer è un software che permette di visualizzare e analizzare le caratteristiche dei geni presenti all'interno di un trascrittoma. Tra le caratteristiche che è possibile visualizzare ci sono sia il numero e la natura degli SNP nelle diverse cultivar sia la sequenza nucleotidica e la sequenza proteica nei tre frames con evidenziati i segnali di inizio e di fine. Il programma permette la comparazione dell'espressione genica tra le diverse cultivar producendo sia grafici dell'andamento dell'espressione sia tavole numeriche con analisi statistiche dei dati. Per una più corretta analisi, ciascun dato di espressione può essere visualizzato ed eliminato dall'utente nel caso in cui uno sbaglio di sequenziamento sia occorso. Tutti i dati, dalle sequenze nucleotidiche all'analisi di espressione, sono esportabili per successive analisi.