IDENTIFICAZIONE DI VARIANTI ALLELICHE DEL GENE LYC-? IN UNA COLLEZIONE DI FRUMENTI TETRAPLOIDI

Recentemente è stata sviluppata una nuova strategia di genetica inversa denominata TILLING (Targeting Induced Local Lesion IN Genomes) in grado di indurre ed identificare nuove varianti alleliche in un gene di interesse. Questa tecnica combina la mutagenesi tradizionale con lo screening mediante PCR al fine di identificare mutazioni puntiformi in una determinata regione genica, offrendo così un modo alternativo per lo studio dei geni che codificano per caratteri di interesse agrario. Per l"individuazione di varianti alleliche naturali presenti in collezioni di germoplasma si ricorre a un adattamento della strategia TILLING, che prende il nome di ecoTILLING (Till et al., 2006). I polimorfismi naturali (SNP, inserzioni e delezioni, microsatelliti) rappresentano una risorsa di variabilità sia a livello fenotipico che a livello della sequenza nucleotidica. Nell"ambito di tale contesto è stata analizzata la variabilità genetica naturale di una collezione di 120 frumenti tetraploidi (T. turgidum) considerando come gene target la licopene ciclasi ? (LYC-?), enzima coinvolto nell"accumulo della luteina. L"analisi è stata condotta su miscele di DNA genomico opportunamente combinate con uguale quantità di DNA di una cultivar di riferimento (Aureo) e di un"accessione in un rapporto 1:1. La collezione di frumenti tetraploidi è stata così valutata per la sua variabilità utilizzando primer specifici per il gene Lyc-?-A1 in grado di discriminare il locus omeologo del genoma A. La strategia dell"ecoTILLING permette di caratterizzare serie alleliche di potenziale utilità per programmi di miglioramento genetico.