Applicazione della citometria a flusso per la quantificazione delle cellule batteriche associate al sedimento fluviale.

La citometria a flusso, associata all'utilizzo di coloranti fluorescenti specifici per la marcatura degli acidi nucleici cellulari (Shapiro, 1995), è molto utilizzata in campo ambientale per la quantificazione dell'abbondanza batterica negli ambienti acquatici, un parametro di base per comprendere il ruolo delle comunità microbiche nei processi ecosistemici (es. ciclo del carbonio, mineralizzazione sostanza organica). La maggior parte degli studi che utilizzano questa tecnica mostra i risultati di analisi effettuate su campioni prelevati dalla colonna d'acqua, per i quali la citometria permette la rapida e precisa enumerazione delle cellule planctoniche, consentendo spesso la distinzione di due o più gruppi cellulari caratterizzati da una diversa morfologia e/o intensità di fluorescenza (Bouvier et al., 2007; Felip et al., 2007).